جک پس از برخوردی پرتنش با فیل و نیروهای ساپینتیا، همراه گروهش برای فرار و پیدا کردن مسیر امن تلاش می‌کند. در ادامه، سرنخ‌هایی از گذشته او و ارتباطش با پروژه‌های SEED، مسیرشان را به خرابه‌های یک سفینه قدیمی می‌کشاند.