نبرد نین و یواِن از مدرسه کودان فراتر می‌رود و پای یک راز فضایی و اطلاعات محرمانه شینوبی‌ها وسط می‌آید. کورو و بقیه باید بین هرج‌ومرج، دستورهای عجیب و تهدیدی بزرگ‌تر راهی برای دوام آوردن پیدا کنند.