بوروتو و تیمش مأمور می‌شوند دست مصنوعی ناروتو را همراه کاتاسکه به مرکز تحقیقاتی ریوتان ببرند؛ مأموریتی که نگاه بوروتو به ابزارهای علمی نینجا را به چالش می‌کشد و هم‌زمان سایه تهدید کارا جدی‌تر می‌شود.