ادوارد و آلفونس برای فهمیدن راز سنگ فیلسوف مخفیانه وارد آزمایشگاه پنجم می‌شوند؛ جایی که قرار بوده متروکه باشد، اما خیلی زود معلوم می‌شود هنوز کسانی از تاریکی آن محافظت می‌کنند.